Высота тропопаузы – переходного слоя между тропосферой и стратосферой – изменяется в зависимости от состояния воздуха под ней, то есть в тропосфере. Приближенно можно считать тропосферу слоем интенсивного перемешивания воздуха, а стратосферу – слоем с устойчивым его состоянием. В зависимости от развивающихся над земной поверхностью процессов, степени прогрева нижних слоев воздуха, высота границы неустойчивости и интенсивного перемешивания может подниматься и опускаться. В теплом воздухе и над областями высокого атмосферного давления она выше, а в холодном и над циклонами – ниже. По этой причине тропопауза расположена ниже над полярными районами и выше – над тропическими областями. Граница между тропосферой и стратосферой в реальных условиях над средними широтами в зависимости от ситуации может располагаться на уровнях от 8 до 13 км, а температура – отличаться на 7-8°С от её стандартных значений (-56,5°С); при этом она будет тем ниже, чем выше окажется тропопауза.