Эта страница истории отечественной гидрометеорологии не получила широкой известности. В годы Великой Отечественной войны гидрометеорологи Черноморского флота по крупицам собирали сведения о гидрологическом режиме Черного моря для того, чтобы как можно более надежно обеспечить данными действия советских подводных лодок. 1 ноября 1944 года командование выделило в распоряжение Морской обсерватории одну из субмарин для проведения научных исследований. Это была подводная лодка М-51, построенная в 1933 году. На переоборудование боевой подлодки в научно-исследовательскую потребовалось несколько месяцев, и уже в 1945 году М-51 совершила свой первый поход для изучения гидрологических условий Черноморского бассейна. Для проведения научных работ в походах участвовали профессиональные гидрологи – сотрудники Морской обсерватории Черноморского флота. М-51 исправно трудилась в интересах науки до октября 1946 года, после чего была возвращена в боевой состав подводных сил Черноморского флота.